今天介紹一本微生物學4區sci期刊：Journal Of Medical Microbiology，是經同行評議的國際期刊，最新影響因子2.4，是4區刊物，是評審人員可選的低分好中期刊。

　　期刊基本信息介紹如下：

　　期刊名稱：Journal Of Medical Microbiology

　　ISSN：0022-2615

　　eISSN：1473-5644

　　IF/JCR分區：2.4/Q3Citescore: 5.2

　　中科院分區：醫學4區

　　發行地區：英國

　　發行周期：月刊

　　期刊分類：醫學(大類)，微生物學(小類)

　　是否SCIE收錄：是

　　出版模式：hybrid

　　研究方向：是醫學、牙科和獸醫微生物學的跨學科期刊，發表醫學領域細菌學、病毒學、真菌學和寄生蟲學相關原創研究。

　　接收文章類型：Research Article、Short Communication、Review、Insight Review、Method、Letter、Personal View、Editorial

　　審稿周期：4.5月(僅供參考)

　　出版費：OA形式發表，要收出版費及增值稅。

　　主頁鏈接：https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/jmm/

　　投稿鏈接：https://www.editorialmanager.com/jmm/Default.aspx

　　作者指南：https://www.microbiologyresearch.org/information-for-authors

　　期刊近期征收的3篇文章參考：

　　01運用全基因組測序法研究耐碳青霉烯類奇異變形桿菌的分子特征和同源性

　　02深部感染近平滑念珠菌復合種亞型對九種抗真菌藥物的體外敏感性

　　03對肝細胞癌患者腸道菌群改變的相關性分析：紅蝽桿菌、奇異菌、糞球菌及殊異韋榮菌組合檢測可能成為新的HCC診斷法

　　01運用全基因組測序法研究耐碳青霉烯類奇異變形桿菌的分子特征和同源性(開放獲取)

　　作者：Mi Liu, Dan Li, Wei Jia, Jie Ma, Xue Zhao

　　作者機構：濰坊市人民醫院檢驗科

　　引言：奇異變形桿菌屬于腸桿菌科，對多種抗菌藥物有天然耐藥性。近年來，不斷有關于耐碳青霉烯類奇異變形桿菌(CR-PMI)導致爆發嚴重院內感染的報告。中國和其他地區很少對這種細菌的全基因組分子特征進行研究，這成為我們的研究動機。

　　假設CR-PMI菌株含有多重耐藥基因，對常用抗菌藥物有高耐藥率。

　　目的本文旨在鑒定CR-PMI菌株的耐藥機制和同源性，并為臨床治療和控制院內感染提供理論依據。

　　研究方法

　　運用基質輔助激光解吸/電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)法鑒定細菌種類。運用VITEK 2系統和Kirby-Bauer(K-B)紙片擴散法測定抗菌藥敏感性。全基因組測序(WGS)通過Illumina平臺NovaSeq測序系統進行。通過運行Abricate軟件的NCBI數據庫鑒定抗生素耐藥基因(ARG)。運用基因組流行病學中心(Center for Genomic Epidemiology)提供的PlasmidFinder鑒定質粒復制子的類型。

　　研究結果

　　2019年7月至2021年9月采自我院的5個CR-PMI菌株幾乎對所有抗菌藥物具有耐藥性，但氨曲南(ATM)、阿米卡星(AMK)和頭孢替坦(CTT)除外。所有CR-PMI菌株都含有碳青霉烯類耐藥基因新德里金屬-β-內酰胺酶 1(blaNDM-1)，兩個菌株含有超廣譜β-內酰胺酶(ESBL)基因blaPER-4和blaCTX-M-65。5個CR-PMI菌株分別包含27、18、30、25和24種耐藥基因。大多數抗菌藥耐藥基因都接受了氨基糖苷類檢測(n=14)，其次是頭孢菌素類(n=7)。系統發育樹分為五個進化組，五個CR-PMI菌株分屬B-E四個進化組。

　　研究結論

　　總體而言，CR-PMI菌株對常用抗菌藥物具有高耐藥率，并含有碳青霉烯類耐藥基因blaNDM-1。CR-PMI菌株在不同時期的不同病房呈多克隆趨勢。最重要的是，所有被鑒定菌株都含有重要的抗菌素耐藥基因，這可能導致嚴重的耐藥性傳播和致命的多重耐藥細菌感染。

　　關鍵詞碳青霉烯類耐藥性，奇異變形桿菌，同源性，耐藥機制

　　02深部感染近平滑念珠菌復合種亞型對九種抗真菌藥物的體外敏感性(開放獲取)

　　作者：Wei Zhang, Minghua Zhan, Na Wang, Jingjing Fan, Xuying Han, Caiqing Li, Jinlu Liu, Jia Li, Yongwang Hou, Xinsheng Wang, Zhihua Zhang

　　作者機構：河北北方學院附屬第一醫院檢驗科疑難重癥及罕見病國家重點實驗室檢驗科北京大學人民醫院檢驗科河北北方學院附屬第一醫院感染科河北北方學院附屬第一醫院呼吸與危重癥醫學科

　　引言：近平滑念珠菌復合種可分為狹義近平滑念珠菌、擬平滑念珠菌和似平滑念珠菌亞型。對其進行分型的藥物敏感性測試并不常見。

　　空白聲明在常規藥敏性報告中，缺乏近平滑念珠菌復合種亞型的藥物敏感性數據。

　　目的本研究旨在探討引起患者深部感染的近平滑念珠菌復合種亞型的抗真菌藥敏性和臨床分布特征。

　　研究方法

　　收集2017年至2019年從深部感染中分離出的近平滑念珠菌復合種非重復菌株。運用基質輔助激光解吸/電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)法進行種級鑒定，并酌情運用ITS基因測序法進行確認。運用Sensititre YeastOne系統法進行抗真菌藥敏性試驗。

　　研究結果

　　本研究共納入244個病例，其中男性176例(72.13%，60.69±13.43歲)，女性68例(27.87%，60.21±10.59歲)。主要疾病為癌癥(43.44%)、心血管疾病(25.00%)、消化系統疾病(18.44%)、感染(6.97%)和腎病(6.15%)。菌株從血流(63.11%)、中心靜脈導管(15.16%)、膿液(6.56%)、腹水(5.74%)、無菌體液(5.33%)和支氣管肺泡灌洗液(BALF，4.09%)中分離。在244個近平滑念珠菌復合種菌株中鑒定出179種(73.26%)狹義近平滑念珠菌，62種(25.41%)擬平滑念珠菌，3種(1.23%)似平滑念珠菌。

　　只有1個狹義近平滑念珠菌菌株對阿尼芬凈(anidulafungin)、米卡芬凈(micafungin)、卡泊芬凈(caspofungin)和伏立康唑(voriconazole)有抗藥性，并且是對兩性霉素B(amphotericin B)耐藥的非野生型(NWT)菌株。此外，6個狹義近平滑念珠菌菌株對氟康唑(fluconazole)耐藥，1個為劑量依賴性敏感菌株。5個狹義近平滑念珠菌菌株是對泊沙康唑(posaconazole)耐藥的非野生型菌株。只有1個擬平滑念珠菌菌株是對阿尼芬凈、米卡芬凈、卡泊芬凈、氟康唑、伏立康唑、兩性霉素B和泊沙康唑耐藥的非野生型菌株，其余菌株均為野生型。

　　研究結論

　　狹義近平滑念珠菌是我院近平滑念珠菌復合種的主要臨床分離株。大多數菌株是從血流中分離。對常用抗真菌藥物的藥敏率超過96%。此外，受感染的患者多為老年男性癌癥患者。

　　關鍵詞唑類，近平滑念珠菌復合種，耐藥性，棘白菌素，野生型

　　03對肝細胞癌患者腸道菌群改變的相關性分析：紅蝽桿菌、奇異菌、糞球菌及殊異韋榮菌組合檢測可能成為新的HCC診斷法(開放獲取)

　　作者：Wenqian Xu, Yan Jiang, Jinglong Tao, Yunhong Liu, Yongwu Xia, Cheng Chen, Xiaoxin Jiang

　　作者機構：

　　深圳市龍華區人民醫院醫學檢驗科武警湖南總隊醫院檢驗科湖南省直中醫醫院醫學檢驗科

　　引言肝細胞癌(HCC)是世界上最常見的惡性腫瘤之一。由于其具有早期診斷率低、惡性程度高、病情進展快的特點，確診患者大多處于中晚期。越來越多的證據表明，腸道菌群失調會擾亂免疫調節(尤其是白細胞介素表達)，從而加重肝細胞癌的病情。因此，基于腸道菌群的方法有可能成為診斷或治療肝細胞癌的新方法。

　　假設肝細胞癌患者和健康人群的腸道菌群組成不同。此外，腸道菌群可能減輕或加重肝細胞癌。

　　研究方法

　　為了確認哪些腸道菌群和白細胞介素會加重肝細胞癌，我們研究了肝細胞癌患者與健康人群之間的腸道菌群組成和白細胞介素(IL)指數差異。我們共招募64名肝細胞癌患者和24名健康人，采集其新鮮糞便樣本和血清樣本進行16S rRNA測序和代謝物指數測定。

　　研究結果

　　數據顯示，在肝細胞癌組和對照組中分別檢測到484個和476個操作分類單元(OTU)。從門一級到種一級，有5、6、10、15、23和19個菌落在肝細胞癌組與健康人群之間顯示出豐度差異。此外，白細胞介素-6和白細胞介素-10的表達在兩組間也有顯著差異。值得注意的是，兩組的紅蝽桿菌(Coriobacterium)、奇異菌(Atopobium)、糞球菌(Coprococcus)屬級差異和殊異韋榮菌(Veillonella dispar)種級差異與IL-6和IL-10明顯相關。

　　研究結論

　　肝細胞癌組腸道菌群的豐度與對照組不同。此外，紅蝽桿菌(Coriobacterium)、奇異菌(Atopobium)、糞球菌(Coprococcus)屬級及殊異韋榮菌(Veillonella dispar)種級組合檢測可能是一種新的肝細胞癌診斷法。

　　關鍵詞肝細胞癌，白細胞介素，腸道菌群，代謝物

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