《海洋與湖沼》刊物以報道基礎和應用基礎研究成果為主，特別重視刊載有影響的重要技術研發成果的論文。刊物內容涉及水圈范圍內的生物學、物理學、化學、地質學等學科及其分支學科，形式有論文、研究簡報、高新技術、高水平綜述、學術爭鳴等。海洋與湖沼 2016年 第4期目錄：

　　基于衛星測高資料的班達海海平面季節及年際變化研究王立偉;王永剛;徐騰飛;魏澤勛 (719)

　　海洋卡盾藻對青島大扁藻的化感作用及其對UV-B輻射的響應唐弘碩;袁夢琪;楊雷;王影 (730)

　　2014年冬季熱帶西太平洋雅浦Y3海山浮游植物葉綠素a濃度及粒級結構張文靜;孫曉霞;陳蕓燕;李俊磊;杜娟 (739)

　　改性粘土絮凝法對小球藻(Chlorella vulgaris)生理生化性質的影響劉淑雅;俞志明;宋秀賢;曹西華 (748)

　　南黃海夏初網采浮游植物分布與長期變化楊洋;孫曉霞;鄭珊;趙永芳 (755)

　　基于ZooScan圖像技術的南黃海夏季浮游動物群落結構分析代魯平;李超倫;王世偉;王延清;張芳 (764)

　　南黃海夏季軟體動物群落結構特征張鵬弛;徐勇;李新正;王洪法;安建梅;張寶琳;帥蓮梅 (774)

　　溫度、餌料種類對中華哲水蚤(Calanus sinicus)油脂積累與生長發育的影響周孔霖;孫松 (787)

　　固相吸附毒素跟蹤技術(SPATT)在浙江南麂海域的應用渠佩佩;楊晶晶;徐軼肖;高寒;佟蒙蒙 (795)

　　2012年長江口及其鄰近海域營養鹽分布的季節變化及影響因素王文濤;曹西華;袁涌銓;宋秀賢;俞志明